--batchSize 50000
--blockSize 5000
--components 1
--cost 0.001
--deleteLater 0
--estimator 2
--exportObservationsToFile 1
--exportParametersToFile 1
--fastqDumpCall fastq-dump
--genomeDir ./genome/
--lambda 10.0
--lessInfo 1
--loadAllOnce 0
--maxBatches 20
--mergeThreshold 10
--outFileNamePrefix ./
--pathToParameters ./VARUSparameters.txt
--pathToRuns ./
--pathToVARUS /home/mario/VARUS/Implementation/
--profitCondition 0
--pseudoCount 1
--qualityThreshold 5
--randomSeed 1
--readParametersFromFile 1
--runThreadN 8
--verbosityDebug 1
